Les molécules derrière les leçons
Quatorze structures réelles, résolues par cristallographie ou par diffraction électronique et déposées dans la Protein Data Bank. Tournez-les, suivez le récit étape par étape, et voyez où le médicament se loge — et, pour l'une d'elles, résolue deux fois, regardez l'enzyme se refermer. Chaque modèle porte son entrée, sa méthode et sa résolution : c'est une preuve, pas une illustration.
Une enzyme qui se referme
La seule entrée qui bouge. Deux structures cristallines d'une même enzyme — refermée sur son substrat, puis ouverte — avec le déplacement entre les deux mesuré et non imaginé.
Chargement du modèle
Faites glisser pour tourner · molette pour zoomer
Une enzyme saisie fermée
L'adénylate kinase déplace un phosphate entre deux nucléotides, et elle ne peut le faire qu'en les tenant tous deux immobiles et en écartant l'eau. Ce qui est dessiné est l'enzyme refermée sur eux : un cœur rigide, et deux volets rabattus sur le site.
Coordonnées issues de la Protein Data Bank (RCSB), domaine public sous CC0 1.0. Modèles réduits : carbones alpha pour les protéines, phosphores pour l'ADN, tous les atomes lourds des ligands.